MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Xylella fastidiosa M23 chromosome

Total Repeats: 53573

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010577	TGA	2	6	23	28	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182680573
2	NC_010577	CCA	2	6	82	87	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	182680573
3	NC_010577	TAG	2	6	179	184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182680573
4	NC_010577	AGT	2	6	243	248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182680573
5	NC_010577	ACA	2	6	274	279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	182680573
6	NC_010577	TAC	2	6	300	305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182680573
7	NC_010577	AC	4	8	347	354	50 %	0 %	0 %	50 %	182680573
8	NC_010577	TTG	2	6	371	376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	182680573
9	NC_010577	CTCG	2	8	394	401	0 %	25 %	25 %	50 %	182680573
10	NC_010577	TGC	2	6	402	407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182680573
11	NC_010577	TGG	2	6	465	470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182680573
12	NC_010577	TGC	2	6	501	506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182680573
13	NC_010577	TTCG	2	8	554	561	0 %	50 %	25 %	25 %	182680573
14	NC_010577	ATTG	2	8	648	655	25 %	50 %	25 %	0 %	182680573
15	NC_010577	T	6	6	667	672	0 %	100 %	0 %	0 %	182680573
16	NC_010577	AAG	2	6	692	697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182680573
17	NC_010577	ATT	2	6	742	747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	182680573
18	NC_010577	CGAT	2	8	830	837	25 %	25 %	25 %	25 %	182680573
19	NC_010577	CCT	2	6	838	843	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	182680573
20	NC_010577	A	8	8	930	937	100 %	0 %	0 %	0 %	182680573
21	NC_010577	TAG	2	6	980	985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182680573
22	NC_010577	CAA	2	6	1063	1068	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	182680573
23	NC_010577	ATT	2	6	1106	1111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	182680573
24	NC_010577	CTGA	2	8	1201	1208	25 %	25 %	25 %	25 %	182680573
25	NC_010577	ACA	2	6	1255	1260	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	182680573
26	NC_010577	C	6	6	1359	1364	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
27	NC_010577	ACT	2	6	1373	1378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_010577	AAAT	2	8	1399	1406	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010577	A	6	6	1428	1433	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010577	ACA	2	6	1543	1548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_010577	A	8	8	1568	1575	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010577	ACC	4	12	1581	1592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_010577	GTA	2	6	1695	1700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182680574
34	NC_010577	TAA	2	6	1738	1743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	182680574
35	NC_010577	GAT	2	6	1793	1798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182680574
36	NC_010577	CAAAAA	2	12	1801	1812	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	182680574
37	NC_010577	GAT	2	6	1914	1919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182680574
38	NC_010577	TAT	3	9	2015	2023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	182680574
39	NC_010577	TTA	2	6	2034	2039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	182680574
40	NC_010577	CAA	2	6	2076	2081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	182680574
41	NC_010577	TTA	2	6	2090	2095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	182680574
42	NC_010577	TG	3	6	2170	2175	0 %	50 %	50 %	0 %	182680574
43	NC_010577	ATT	2	6	2214	2219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	182680574
44	NC_010577	TTA	2	6	2253	2258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	182680574
45	NC_010577	ATTG	2	8	2342	2349	25 %	50 %	25 %	0 %	182680574
46	NC_010577	GGC	2	6	2444	2449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182680574
47	NC_010577	GTG	2	6	2473	2478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182680574
48	NC_010577	AAG	3	9	2533	2541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182680574
49	NC_010577	GAA	2	6	2547	2552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182680574
50	NC_010577	ATT	2	6	2602	2607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	182680574
51	NC_010577	GTG	2	6	2632	2637	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182680574
52	NC_010577	TTC	2	6	2669	2674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182680574
53	NC_010577	AGT	2	6	2714	2719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182680574
54	NC_010577	ATA	2	6	2755	2760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010577	ATA	2	6	2772	2777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010577	T	7	7	2786	2792	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010577	ATTTA	2	10	2811	2820	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010577	TAA	2	6	2828	2833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010577	TAA	2	6	2883	2888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010577	TTTA	2	8	2889	2896	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010577	TGT	2	6	2919	2924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010577	T	6	6	2927	2932	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010577	ATG	2	6	2941	2946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010577	TTA	2	6	2965	2970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010577	T	6	6	2971	2976	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010577	TCA	2	6	2983	2988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_010577	TTC	2	6	2989	2994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_010577	GTT	2	6	3078	3083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	182680575
69	NC_010577	TTTC	2	8	3097	3104	0 %	75 %	0 %	25 %	182680575
70	NC_010577	T	6	6	3121	3126	0 %	100 %	0 %	0 %	182680575
71	NC_010577	TAAT	2	8	3279	3286	50 %	50 %	0 %	0 %	182680575
72	NC_010577	ACGTCG	2	12	3289	3300	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	182680575
73	NC_010577	AGT	2	6	3410	3415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182680575
74	NC_010577	TCA	2	6	3423	3428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182680575
75	NC_010577	ACG	2	6	3445	3450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182680575
76	NC_010577	ATT	2	6	3469	3474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	182680575
77	NC_010577	AAC	2	6	3528	3533	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	182680575
78	NC_010577	AGAA	2	8	3552	3559	75 %	0 %	25 %	0 %	182680575
79	NC_010577	GA	3	6	3641	3646	50 %	0 %	50 %	0 %	182680575
80	NC_010577	AAC	2	6	3651	3656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	182680575
81	NC_010577	TTTTAA	2	12	3706	3717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	182680575
82	NC_010577	ATGG	2	8	3720	3727	25 %	25 %	50 %	0 %	182680575
83	NC_010577	CGT	2	6	3728	3733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182680575
84	NC_010577	TTGA	2	8	3746	3753	25 %	50 %	25 %	0 %	182680575
85	NC_010577	TTTA	2	8	3757	3764	25 %	75 %	0 %	0 %	182680575
86	NC_010577	T	6	6	3859	3864	0 %	100 %	0 %	0 %	182680575
87	NC_010577	CTA	2	6	3902	3907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182680575
88	NC_010577	T	6	6	3923	3928	0 %	100 %	0 %	0 %	182680575
89	NC_010577	T	6	6	4078	4083	0 %	100 %	0 %	0 %	182680575
90	NC_010577	ATT	2	6	4174	4179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010577	TCT	2	6	4220	4225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_010577	ATT	2	6	4317	4322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010577	AT	3	6	4363	4368	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010577	T	6	6	4373	4378	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010577	AGAA	2	8	4408	4415	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010577	GATA	2	8	4545	4552	50 %	25 %	25 %	0 %	182680576
97	NC_010577	GCT	2	6	4657	4662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182680577
98	NC_010577	GGC	2	6	4670	4675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182680577
99	NC_010577	AT	3	6	4676	4681	50 %	50 %	0 %	0 %	182680577
100	NC_010577	TAC	2	6	4701	4706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182680577
101	NC_010577	CAC	2	6	4775	4780	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	182680577
102	NC_010577	GTCT	2	8	4867	4874	0 %	50 %	25 %	25 %	182680577
103	NC_010577	AGA	2	6	4918	4923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182680577
104	NC_010577	TGG	2	6	4966	4971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182680577
105	NC_010577	CGA	2	6	4978	4983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182680577
106	NC_010577	TGG	2	6	5002	5007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182680577
107	NC_010577	CAA	2	6	5090	5095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	182680577
108	NC_010577	TAC	2	6	5158	5163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182680577
109	NC_010577	TCCT	2	8	5246	5253	0 %	50 %	0 %	50 %	182680577
110	NC_010577	AGTT	2	8	5269	5276	25 %	50 %	25 %	0 %	182680577
111	NC_010577	TGAT	2	8	5277	5284	25 %	50 %	25 %	0 %	182680577
112	NC_010577	GTG	2	6	5289	5294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182680577
113	NC_010577	GGT	2	6	5324	5329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182680577
114	NC_010577	TTG	2	6	5415	5420	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	182680577
115	NC_010577	TGC	2	6	5425	5430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182680577
116	NC_010577	TGC	2	6	5524	5529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182680577
117	NC_010577	TGA	2	6	5602	5607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182680577
118	NC_010577	TTC	2	6	5662	5667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182680577
119	NC_010577	GGA	2	6	5737	5742	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	182680577
120	NC_010577	TGC	2	6	5797	5802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182680577
121	NC_010577	GCT	2	6	5816	5821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182680577
122	NC_010577	TCG	2	6	5931	5936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182680577
123	NC_010577	CTG	2	6	5946	5951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182680577
124	NC_010577	A	6	6	5980	5985	100 %	0 %	0 %	0 %	182680577
125	NC_010577	CT	3	6	6050	6055	0 %	50 %	0 %	50 %	182680577
126	NC_010577	TCA	2	6	6144	6149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182680577
127	NC_010577	T	7	7	6203	6209	0 %	100 %	0 %	0 %	182680577
128	NC_010577	ATTG	2	8	6226	6233	25 %	50 %	25 %	0 %	182680577
129	NC_010577	GCC	2	6	6259	6264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182680577
130	NC_010577	GCC	2	6	6382	6387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182680577
131	NC_010577	AT	3	6	6424	6429	50 %	50 %	0 %	0 %	182680577
132	NC_010577	CGC	2	6	6430	6435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182680577
133	NC_010577	CCT	2	6	6478	6483	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	182680577
134	NC_010577	TGA	2	6	6625	6630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182680577
135	NC_010577	ACA	2	6	6631	6636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	182680577
136	NC_010577	GCC	2	6	6641	6646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182680577
137	NC_010577	TTG	2	6	6647	6652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	182680577
138	NC_010577	CAAT	2	8	6803	6810	50 %	25 %	0 %	25 %	182680577
139	NC_010577	GAA	2	6	6853	6858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182680577
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268	NC_010577	TTA	2	6	12651	12656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	182680584
269	NC_010577	AG	3	6	12715	12720	50 %	0 %	50 %	0 %	182680584
270	NC_010577	CCG	3	9	12750	12758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182680584
271	NC_010577	CAATT	2	10	12760	12769	40 %	40 %	0 %	20 %	182680584
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280	NC_010577	TAC	2	6	13002	13007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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282	NC_010577	T	8	8	13068	13075	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
283	NC_010577	ATAC	2	8	13129	13136	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
284	NC_010577	GC	3	6	13154	13159	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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389	NC_010577	CCG	2	6	19206	19211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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391	NC_010577	GTCGT	2	10	19257	19266	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
392	NC_010577	GTG	2	6	19286	19291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
393	NC_010577	CTG	2	6	19298	19303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
394	NC_010577	ATG	2	6	19340	19345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
395	NC_010577	TG	4	8	19344	19351	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
396	NC_010577	TC	3	6	19358	19363	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
397	NC_010577	TTG	2	6	19382	19387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
398	NC_010577	GGCAAC	25	150	19388	19537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
399	NC_010577	GTGG	2	8	19603	19610	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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